靠谱的南京中介机构有：链家、贝壳找房、自如等。

解释：

1. 链家

链家是一家知名的房产中介机构，在南京拥有较高的知名度和良好的口碑。该机构拥有专业的房产顾问团队，能够为客户提供全方位的房产咨询服务。链家的服务流程规范，交易过程透明，能够保障客户的权益，因此被认为是较为靠谱的中介机构。

2. 贝壳找房

贝壳找房是另一家在南京受到认可的中介机构。该机构拥有广泛的房源信息，能够提供客户多样化的选择。贝壳找房注重线上服务，客户可以通过其APP或官网方便地查询房源、预约看房。同时，该机构的服务团队专业，能够提供专业的购房建议，帮助客户找到适合的房源。

3. 自如

自如是一家主要从事租赁业务的中介机构，在南京的租赁市场有一定的市场份额。自如的房源较多，能够满足不同客户的需求。该机构的服务流程规范，对房源进行严格的审核和装修，确保房源的质量。此外，自如还提供一系列租赁服务，如维修、保洁等，为租户提供便利。

以上三家中介机构在南京均有一定的市场份额和良好的口碑，能够为客户提供专业的服务。但选择中介机构时，仍需谨慎，了解机构的资质、口碑和服务内容，以确保自己的权益得到保障。